Součásti Ochrana před souborovými hrozbami umožňuje zabránit infikování souborového systému počítače. Ve výchozím nastavení je součást Ochrana před souborovými hrozbami trvale uložena v paměti RAM počítače. Tato součást prohledává soubory na všech jednotkách počítače i na připojených jednotkách. Tato součást poskytuje ochranu počítače pomocí antivirových databází, cloudové služby Kaspersky Security Network a heuristické analýzy.
Součást prohledává soubory, k nimž přistoupil uživatel nebo aplikace. Pokud je zjištěn škodlivý soubor, aplikace Kaspersky Endpoint Security blokuje aktivitu tohoto souboru. Aplikace poté škodlivý soubor dezinfikuje nebo odstraní v závislosti na nastavení součásti Ochrana před souborovými hrozbami.
Když se pokusíte o přístup k souboru, jehož obsah je uložen v cloudu OneDrive, aplikace Kaspersky Endpoint Security stáhne a zkontroluje obsah tohoto souboru.